Pourquoi est-il important d'améliorer le diagnostic de la tuberculose ?
Chaque année, on estime qu'un million d'enfants et de jeunes adolescents tombent malades de la tuberculose et qu'environ 226 000 en meurent. La tuberculose est causée par la bactérie Mycobacterium tuberculosis et affecte principalement les poumons (tuberculose pulmonaire), bien qu'elle puisse toucher d'autres sites du corps (tuberculose extrapulmonaire). Les signes et symptômes de la tuberculose pulmonaire sont la toux, la fièvre, les sueurs nocturnes et la perte de poids. Les signes et symptômes de la tuberculose extrapulmonaire dépendent du site de la maladie. Lorsqu'elle est détectée à temps et traitée efficacement, la tuberculose est largement guérissable.
Ne pas reconnaître la tuberculose à temps (faux négatif) pourrait entraîner un retard de diagnostic et de traitement, une maladie grave et la mort. Un diagnostic à tort de tuberculose (faux positif) pourrait entraîner de l'anxiété, un traitement inutile (qui peut entraîner des effets secondaires des médicaments) et la possibilité de passer à côté d'autres diagnostics qui nécessitent un traitement.
Quel était l’objectif de la revue ?
Déterminer la précision du Xpert Ultra chez les enfants présentant des symptômes de tuberculose pour le diagnostic de la tuberculose pulmonaire, de la méningite tuberculeuse (affectant les membranes qui entourent le cerveau et la moelle épinière), de la tuberculose ganglionnaire (gonflement douloureux d'un ou plusieurs ganglions lymphatiques, qui sont des structures en forme de haricot qui aident à combattre les infections) et de la résistance à la rifampicine.
Qu'étudie cette revue ?
Xpert Ultra, un test rapide recommandé par l'Organisation mondiale de la santé qui détecte simultanément la tuberculose et la résistance à la rifampicine chez les adultes et les enfants présentant des symptômes de tuberculose. La rifampicine est un médicament important utilisé pour traiter la tuberculose. Pour le diagnostic de la tuberculose, nous avons évalué les résultats par rapport à deux points de référence différents : la culture de la tuberculose (une méthode utilisée pour cultiver des bactéries sur des milieux riches en nutriments) et une définition composite basée sur les symptômes, la radiographie pulmonaire, l'examen microscopique des expectorations (examen au microscope du mucus et d'autres matières crachées par les poumons) et la culture. Pour la détection de la résistance à la rifampicine, nous avons évalué les résultats par rapport aux tests de sensibilité aux médicaments ou aux tests moléculaires d’hybridation inverse en ligne (un test rapide de laboratoire pour détecter les bactéries de la tuberculose).
Quels ont été les principaux résultats de cette revue ?
Nous avons inclus 14 études. Pour la tuberculose pulmonaire, nous avons analysé 335 ensembles de données (environ 26 000 participants). Aucune étude n'a évalué la précision du Xpert Ultra pour la méningite tuberculeuse ou la tuberculose ganglionnaire. Trois études ont évalué la précision d'Xpert Ultra pour la détection de la résistance à la rifampicine.
Pour une population de 1000 enfants :
• où 100 ont une tuberculose pulmonaire dans les expectorations selon les résultats de la culture :
- 101 seraient positifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 26 (26 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 899 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 25 (3%) auraient une tuberculose (faux négatifs).
• où 100 ont une tuberculose pulmonaire dans l'aspiration gastrique (recueil des sécrétions pulmonaires et orales de l'estomac) selon les résultats de la culture :
- 97 seraient positifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 27 (28 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 903 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 30 (3 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
• où 100 ont une tuberculose pulmonaire dans les selles selon les résultats de la culture :
- 74 seraient positifs au test Xpert Ultra et parmi eux, 18 (24 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 926 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 44 (5 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
• où 100 ont une tuberculose pulmonaire dans l'aspiration nasopharyngée (sécrétions de la partie supérieure de la gorge, derrière le nez) selon les résultats de la culture :
- 66 seraient positifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 22 (33 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 934 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 56 (6 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
Xpert Ultra a permis de détecter avec précision la résistance à la rifampicine, mais les études sont peu nombreuses et seuls trois enfants présentant une résistance à la rifampicine ont été inclus.
Quelle est notre niveau de confiance dans les résultats de la revue ?
Pour la tuberculose pulmonaire, nous sommes assez confiants car nous avons inclus des études provenant de différents pays et utilisé deux références différentes, bien qu'aucune ne soit parfaite. Cependant, la base de données probantes est encore limitée et il y avait peu d'études avec peu d'enfants pour l'un des types de spécimen (aspiration nasopharyngée).
Pour la résistance à la rifampicine, nous avons identifié quelques études avec très peu d'enfants présentant une résistance à la rifampicine, nous sommes donc moins confiants.
À quels enfants s'appliquent les résultats de cette revue ?
Les enfants et les jeunes adolescents (de la naissance à 14 ans), séropositifs ou séronégatifs, présentant des signes ou des symptômes de tuberculose pulmonaire. Les résultats s'appliquent également aux enfants atteints de pneumonie ou de malnutrition sévères et présentant des symptômes de tuberculose. Dans cette revue, nous n'avons pas identifié d'études évaluant la précision du Xpert Ultra pour la méningite tuberculeuse ou la tuberculose ganglionnaire.
Quelles sont les implications de cette revue ?
Les résultats suggèrent que le Xpert Ultra dans les expectorations, l'aspiration gastrique, les selles et l'aspiration nasopharyngée est une méthode précise pour détecter la tuberculose pulmonaire et la résistance à la rifampicine chez les enfants.
En utilisant Xpert Ultra dans les expectorations, les aspirations gastriques, les selles et les aspirations nasopharyngées, le risque de manquer un diagnostic de tuberculose pulmonaire (confirmé par une culture) est faible, ce qui suggère que seul un faible nombre d'enfants ne recevra pas de traitement. Le risque de diagnostiquer à tort une tuberculose pulmonaire chez un enfant est légèrement plus élevé. Cela pourrait conduire à ce que certains enfants reçoivent un traitement inutile.
Cette revue est-elle à jour ?
Cette revue met à jour notre revue précédente et inclut les données probantes publiées jusqu'au 9 mars 2021.
Nous avons constaté que la sensibilité du Xpert Ultra varie en fonction du type d'échantillon, avec les expectorations présentant la sensibilité la plus élevée, suivies des aspirations gastriques et des selles. L'aspiration nasopharyngée avait la plus faible sensibilité. La spécificité d'Xpert Ultra était élevée par rapport aux standards de référence microbiologiques et composites. Cependant, les données probantes sont encore limitées, et les résultats pourraient être imprécis et varier selon les contextes d'étude. Bien que nous ayons trouvé que le Xpert Ultra était précis pour la détection de la résistance à la rifampicine, les résultats étaient basés sur un nombre d'études très faible qui ne comprenaient que trois enfants présentant une résistance à la rifampicine. Par conséquent, les résultats doivent être interprétés avec prudence. Nos résultats soutiennent l'utilisation d'Xpert Ultra comme diagnostic moléculaire rapide initial chez les enfants évalués pour la tuberculose.
Chaque année, on estime qu'un million d'enfants et de jeunes adolescents tombent malades de la tuberculose, et qu'environ 226 000 d'entre eux en meurent. Le Xpert MTB/RIF Ultra (Xpert Ultra) est un test moléculaire de diagnostic rapide recommandé par l'Organisation mondiale de la santé (OMS) qui détecte simultanément le complexe Mycobacterium tuberculosis et la résistance à la rifampicine. Nous avons précédemment publié une revue Cochrane intitulée « Tests Xpert MTB/RIF et Xpert MTB/RIF Ultra dans la détection de la tuberculose active et la résistance à la rifampicine chez les enfants » Cette revue met à jour les données probantes sur la précision diagnostique de l'Xpert Ultra chez les enfants suspectés d’être atteints de tuberculose. Certaines parties de cette mise à jour de la revue ont inspiré la mise à jour de 2022 des recommandations de l'OMS sur la prise en charge de la tuberculose chez les enfants et les adolescents.
Évaluer la précision diagnostique de l'Xpert Ultra pour détecter : la tuberculose pulmonaire, la méningite tuberculeuse, la tuberculose des ganglions lymphatiques et la résistance à la rifampicine, chez les enfants atteints de tuberculose présumée.
Objectifs secondaires
Examiner les sources potentielles d'hétérogénéité dans les estimations de précision. Pour la détection de la tuberculose, nous avons considéré l'âge, les comorbidités (VIH, pneumonie grave et malnutrition grave) et le type d’échantillon comme sources potentielles.
Résumer la fréquence des résultats à partir de traces avec Xpert Ultra.
Nous avons effectué des recherches dans le registre spécialisé du groupe Cochrane sur les maladies infectieuses, MEDLINE, Embase, trois autres bases de données et trois registres d’essais, sans restriction linguistique, jusqu'au 9 mars 2021.
Études transversales et de cohorte et essais randomisés ayant évalué Xpert Ultra chez des enfants séropositifs et séronégatifs au VIH de moins de 15 ans. Nous avons inclus les études en cours qui nous ont aidés à répondre aux objectifs de la revue. Nous avons inclus des études évaluant des échantillons d’expectorations, d'estomac, de selles ou du nasopharynx (tuberculose pulmonaire), de liquide céphalo-rachidien (méningite tuberculeuse) et de tissus prélevés par aspiration à l'aiguille fine ou par biopsie chirurgicale (tuberculose des ganglions lymphatiques). Pour la détection de la tuberculose, les standards de référence étaient microbiologiques (culture) ou standards de référence composites ; pour les selles, nous avons également inclus Xpert Ultra réalisé sur un échantillon respiratoire de routine. Pour détecter la résistance à la rifampicine, les standards de référence étaient les tests de sensibilité aux médicaments ou le MTBDRplus.
Deux auteurs de la revue ont indépendamment extrait les données et, à l'aide de QUADAS-2, ont évalué la qualité méthodologique en jugeant le risque de biais séparément pour chaque condition cible et test de référence. Pour chaque condition cible, nous avons utilisé le modèle bivarié pour estimer la sensibilité et la spécificité combinées avec des intervalles de confiance (IC) à 95 %. Nous avons stratifié toutes les analyses par type de test de référence. Nous avons résumé la fréquence résultats à partir de traces d’Xpert Ultra ; les traces représentent la détection d'une très faible quantité d'ADN de Mycobacterium tuberculosis. Nous avons évalué le niveau de confiance des données probantes en utilisant le système GRADE.
Nous avons identifié 14 études (11 nouvelles études depuis la revue précédente). Pour la détection de la tuberculose pulmonaire, 335 ensembles de données (25 937 participants) étaient disponibles pour l'analyse. Nous n'avons pas identifié d'études évaluant la précision du Xpert Ultra pour la méningite tuberculeuse ou la tuberculose ganglionnaire. Trois études ont évalué Xpert Ultra pour la détection de la résistance à la rifampicine. Dix études (71 %) ont eu lieu dans des pays à prévalence élevée de tuberculose selon la classification de l'OMS. Dans l'ensemble, le risque de biais était faible.
Détection de la tuberculose pulmonaire
Expectorations, 5 études
La sensibilité combinée du Xpert Ultra vérifiée par culture était de 75,3 % (IC à 95 % entre 64,3 et 83,8 ; 127 participants ; données probantes d’un niveau de confiance élevé), et la spécificité était de 97,1 % (IC à 95 % entre 94,7 et 98,5 ; 1054 participants ; données probantes d’un niveau de confiance élevé).
Aspiration gastrique, 7 études
La sensibilité combinée du Xpert Ultra vérifiée par culture était de 70,4 % (IC à 95 % entre 53,9 et 82,9 ; 120 participants ; données probantes d’un niveau de confiance modéré), et la spécificité était de 94,1 % (IC à 95 % entre 84,8 et 97,8 ; 870 participants ; données probantes d’un niveau de confiance modéré).
Selles, 6 études
La sensibilité combinée du Xpert Ultra vérifiée par culture était de 56,1 % (IC à 95 % entre 39,1 et 71,7 ; 200 participants ; données probantes d’un niveau de confiance modéré), et la spécificité était de 98,0 % (IC à 95 % entre 93,3 et 99,4 ; 1 232 participants ; données probantes d’un niveau de confiance modéré).
Aspiration nasopharyngée, 4 études
La sensibilité combinée du Xpert Ultra vérifiée par la culture était de 43,7 % (IC à 95 % entre 26,7 et 62,2 ; 46 participants ; données probantes d’un niveau de confiance très faible), et la spécificité était de 97,5 % (IC à 95 % entre 93,6 et 99,0 ; 489 participants ; données probantes d’un niveau de confiance élevé).
La sensibilité du Xpert Ultra était plus faible par rapport à un standard de référence composite que par rapport à un standard de référence de culture pour tous les types d'échantillons autres que l'aspiration nasopharyngée, tandis que la spécificité était similaire par rapport aux deux standards de référence.
Interprétation des résultats
En théorie, pour une population de 1000 enfants :
• où 100 ont une tuberculose pulmonaire dans les expectorations selon les résultats de la culture :
- 101 seraient positifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 26 (26 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 899 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 25 (3%) auraient une tuberculose (faux négatifs).
• où 100 ont une tuberculose pulmonaire dans l’aspiration gastrique selon les résultats de la culture :
- 123 seraient positifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 53 (43 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 877 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 30 (3 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
- où 100 ont une tuberculose pulmonaire dans les selles (par culture) :
- 74 seraient positifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 18 (24 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 926 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 44 (5 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
- dont 100 ont une tuberculose pulmonaire dans l'aspiration nasopharyngée (par culture) :
- 66 seraient positifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 22 (33 %) n'auraient pas de tuberculose pulmonaire (faux positifs) ; et
- 934 seraient négatifs au test Xpert Ultra, et parmi eux, 56 (6 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
Détection de la résistance à la rifampicine
La sensibilité du Xpert Ultra était de 100 % (3 études, 3 participants ; données probantes d’un niveau de confiance très faible), et la spécificité se situait entre 97 % et 100 % (3 études, 128 participants ; données probantes d’un niveau de confiance faible).
Résultats à partir de traces
Les résultats de l'Xpert Ultra à partir de traces, considérés comme positifs chez les enfants selon les standards de l'OMS, étaient fréquents. La spécificité d'Xpert Ultra est restée élevée chez les enfants, malgré la fréquence des résultats à partir de traces.
Post-édition effectuée par Astrid Zessler et Cochrane France. Une erreur de traduction ou dans le texte d'origine ? Merci d'adresser vos commentaires à : traduction@cochrane.fr