Pourquoi l'utilisation des tests Xpert dans le dépistage de la tuberculose pulmonaire est-elle importante ?
La tuberculose est la principale cause de décès liée aux maladies infectieuses et l'une des dix premières causes de décès dans le monde. L'Organisation mondiale de la santé (OMS) recommande l'utilisation de tests rapides spécifiques comme tests initiaux dans le diagnostic de la tuberculose et de la résistance à la rifampicine chez les personnes présentant des signes et des symptômes de tuberculose. Cependant, l'OMS estime que près d'un tiers de tous les cas de tuberculose active ne sont ni diagnostiqués ni déclarés. Le fait de ne pas reconnaître la tuberculose lorsqu'elle est présente (un résultat faussement négatif) peut entraîner la maladie et la mort, ainsi qu'un risque accru d'infecter d'autres personnes. Un diagnostic erroné de tuberculose (résultat faussement positif) peut conduire à administrer des antibiotiques à des personnes qui n'en tirent pas de bénéfice.
Quel est l’objectif de cette revue ?
Estimer la précision de Xpert MTB/RIF et Xpert Ultra en tant que tests de dépistage de la tuberculose pulmonaire et de la résistance à la rifampicine chez les adultes présentant ou non des symptômes de tuberculose (tels que toux, fièvre, perte de poids et sueurs nocturnes). Nous nous sommes intéressés au fonctionnement des tests dans les groupes à haut risque de tuberculose, notamment les personnes vivant avec le VIH (PVVIH), les contacts familiaux des personnes atteintes de tuberculose, les mineurs, les personnes emprisonnées, les diabétiques et le grand public.
Qu'étudie cette revue ?
Xpert MTB/RIF et Xpert Ultra sont des tests rapides permettant de diagnostiquer simultanément la tuberculose et la résistance à la rifampicine. Nous avons combiné les résultats des études pour déterminer :
- la sensibilité : personnes atteintes de tuberculose (résistance à la rifampicine) correctement diagnostiquées ;
- la spécificité : personnes non atteintes de tuberculose (résistance à la rifampicine) correctement identifiées.
Plus la sensibilité et la spécificité sont proches de 100 %, meilleur est le test.
Quels sont les principaux résultats de cette revue ?
Vingt-et-une études : 18 études (13 114 participants) ont évalué Xpert MTB/RIF en tant que test de dépistage de la tuberculose pulmonaire et une étude (571 participants) a évalué à la fois Xpert MTB/RIF et Xpert Ultra. Trois études (159 participants) ont évalué Xpert MTB/RIF dans la résistance à la rifampicine.
Pour 1 000 personnes testées, si 50 avaient la tuberculose selon l’étalon de référence :
PVVIH
- Xpert MTB/RIF (12 études) :
· 40 personnes obtiendraient un résultat positif, dont 9 sans tuberculose (sensibilité de 62 %)
· 960 personnes obtiendraient un résultat négatif, dont 19 atteintes de tuberculose (spécificité de 99 %)
- Xpert Ultra (1 étude) :
· 53 personnes obtiendraient un résultat positif, dont 19 sans tuberculose (sensibilité de 69 %)
· 947 personnes obtiendraient un résultat négatif, dont 16 atteintes de tuberculose (spécificité de 98 %)
Pour 1 000 personnes testées, si 10 avaient la tuberculose selon l’étalon de référence :
Autres groupes à haut risque combinés
- Xpert MTB/RIF (5 études) :
· 19 personnes obtiendraient un résultat positif, dont 12 sans tuberculose (sensibilité de 69 %)
· 981 personnes obtiendraient un résultat négatif, dont 3 atteintes de tuberculose (spécificité de 99 %)
Pour la détection de la résistance à la rifampicine, la sensibilité du test Xpert MTB/RIF était de 81 % et 100 % (2 études) et la spécificité de 94 % à 100 % (3 études).
Les résultats des études de cette revue sont-ils fiables ?
Dans les études incluses, les étalons de référence dans le diagnostic de la tuberculose pulmonaire (culture) et de la résistance à la rifampicine (test de sensibilité aux médicaments) sont susceptibles d'avoir été des méthodes fiables pour décider si les patients étaient réellement atteints des affections. Nous étions relativement confiants dans les résultats du test Xpert MTB/RIF chez les PVVIH, et moins pour d’autres groupes à haut risque. Le nombre de personnes étudiées n'est pas suffisant pour garantir la fiabilité des résultats obtenus pour Xpert Ultra ou pour la détection de la résistance à la rifampicine.
À qui s’appliquent les résultats de cette revue ?
Les études ont été réalisées principalement dans des lieux où la tuberculose et le VIH sont très répandus. Aucune étude n'a évalué ces tests chez les personnes atteintes de diabète sucré ou dans la population générale.
Quelles sont les implications de cette revue ?
Chez les PVVIH, le test de dépistage Xpert MTB/RIF s'est avéré précis pour la tuberculose dans les milieux où la tuberculose est très répandue. Dans les groupes à haut risque, le test Xpert MTB/RIF pourrait contribuer à identifier la tuberculose, mais les données probantes sont d’un niveau de confiance faible. Chez les PVVIH, la sensibilité du test Xpert Ultra était légèrement supérieure à celle du test Xpert MTB/RIF et la spécificité similaire, d'après une étude. La résistance à la rifampicine n’a concerné qu’un faible nombre d’études et de personnes testées ; en outre, aucune étude n'a évalué les tests chez les personnes diabétiques ou dans la population générale.
Cette revue est-elle à jour ?
19 mars 2020.
Parmi les groupes à haut risque évalués, le Xpert MTB/RIF appliqué comme test de dépistage était précis pour la tuberculose dans les milieux avec un fardeau important de tuberculeuse. La sensibilité et la spécificité étaient similaires chez les personnes vivant avec le VIH et les personnes non hospitalisées appartenant à des groupes à haut risque. Chez les personnes vivant avec le VIH, la sensibilité du test Xpert Ultra était légèrement supérieure à celle du test Xpert MTB/RIF et la spécificité similaire. Comme il n'existait qu'une seule étude sur Xpert Ultra dans cette analyse, les résultats doivent être interprétés avec prudence. Aucune étude n'a évalué les tests chez les personnes atteintes de diabète sucré et dans d'autres groupes considérés à haut risque de tuberculose, ni dans la population générale.
La tuberculose est l'une des principales causes de décès liées aux maladies infectieuses et l'une des dix premières causes de décès dans le monde. L'Organisation mondiale de la santé (OMS) recommande l'utilisation de tests moléculaires rapides spécifiques, notamment Xpert MTB/RIF ou Xpert Ultra, comme tests de diagnostic initial dans la détection de la tuberculose et de la résistance à la rifampicine chez les personnes présentant des signes et des symptômes de tuberculose. Cependant, l'OMS estime que près d'un tiers de tous les cas de tuberculose active ne sont ni diagnostiqués ni déclarés. Nous avons voulu savoir si un seul test, Xpert MTB/RIF ou Xpert Ultra, pouvait être utile comme test de dépistage pour combler cette lacune diagnostique et améliorer la détection des cas de tuberculose.
Estimer la précision des tests Xpert MTB/RIF et Xpert Ultra dans le dépistage de la tuberculose pulmonaire chez les adultes, indépendamment des signes ou symptômes de tuberculose pulmonaire, dans les groupes à haut risque et dans la population générale. Le dépistage « indépendamment des signes ou des symptômes » fait référence au dépistage des personnes qui n'ont pas fait l’objet d’une évaluation en ce qui concerne la présence de symptômes de tuberculose (par exemple, la toux).
Estimer la précision des tests Xpert MTB/RIF et Xpert Ultra dans le cadre de la détection de la résistance à la rifampicine chez les adultes dépistés pour la tuberculose, indépendamment des signes et symptômes de tuberculose pulmonaire, dans les groupes à haut risque et dans la population générale.
Nous avons effectué des recherches dans 12 bases de données, y compris le registre spécialisé du groupe Cochrane sur les maladies infectieuses, MEDLINE et Embase, le 19 mars 2020, sans restriction sur la langue. Nous avons également examiné les références bibliographiques des articles inclus et des revues Cochrane connexes, et nous avons contacté des chercheurs du domaine pour identifier des études supplémentaires.
Études transversales et de cohorte dans lesquelles des adultes (15 ans et plus) appartenant à des groupes à haut risque (par exemple, personnes vivant avec le VIH, contacts familiaux de personnes atteintes de tuberculose) ou à la population générale ont été soumis à un dépistage de la tuberculose pulmonaire à l'aide du test Xpert MTB/RIF ou Xpert Ultra. Pour la détection de la tuberculose, l’étalon de référence était la culture. Pour la détection de la résistance à la rifampicine, les étalons de référence étaient les tests de sensibilité aux médicaments (culture) et les tests moléculaires d’hybridation inverse en ligne.
Deux auteurs de la revue ont, de manière indépendante, extrait les données à l’aide d’un formulaire standardisé et ont évalué le risque de biais et l'applicabilité avec QUADAS-2. Nous avons utilisé un modèle bivarié à effets aléatoires pour estimer la sensibilité et la spécificité combinées avec des intervalles de crédibilité (ICr) à 95 %, séparément pour la détection de la tuberculose et la détection de la résistance à la rifampicine. Nous avons estimé tous les modèles à l’aide d’une approche bayésienne. Pour la détection de la tuberculose, nous avons d'abord estimé la précision du dépistage dans des groupes à haut risque distincts, notamment les personnes vivant avec le VIH, les contacts familiaux, les personnes emprisonnées et les mineurs, puis dans plusieurs groupes à haut risque combinés.
Nous avons inclus un total de 21 études : 18 études (13 114 participants) ont évalué Xpert MTB/RIF en tant que test de dépistage de la tuberculose pulmonaire et une étude (571 participants) a évalué à la fois Xpert MTB/RIF et Xpert Ultra. Trois études (159 participants) ont évalué Xpert MTB/RIF dans la résistance à la rifampicine. Quinze études (75 %) ont été menées dans des pays avec un fardeau important de tuberculose et 16 études (80 %) dans des pays avec un fardeau important de tuberculose/VIH. Nous avons jugé que la plupart des études présentaient un faible risque de biais dans les quatre domaines QUADAS-2 et une faible préoccupation quant à l'applicabilité.
Xpert MTB/RIF et Xpert Ultra comme tests de dépistage de la tuberculose pulmonaire
Chez les personnes vivant avec le VIH (12 études), la sensibilité et la spécificité combinées du test Xpert MTB/RIF (ICr à 95 %) étaient de 61,8 % (53,6 à 69,9) (602 participants ; données probantes d’un niveau de confiance modéré) et de 98,8 % (98,0 à 99,4) (4 173 participants ; données probantes d’un niveau de confiance élevé). Sur 1 000 personnes dont 50 ont une tuberculose en culture, 40 seraient Xpert MTB/RIF-positives, parmi celles-ci 9 (22 %) n'auraient pas de tuberculose (faux positifs) ; 960 seraient Xpert MTB/RIF-négatives, parmi celles-ci 19 (2 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
Chez les personnes vivant avec le VIH (1 étude), la sensibilité et la spécificité du test Xpert Ultra (IC à 95 %) étaient de 69 % (57 à 80) (68 participants ; données probantes d’un niveau de confiance très faible) et de 98 % (97 à 99) (503 participants ; données probantes d’un niveau de confiance modéré). Sur 1 000 personnes dont 50 ont une tuberculose en culture, 53 seraient Xpert Ultra-positives, parmi celles-ci 19 (36 %) n'auraient pas de tuberculose (faux positifs) ; 947 seraient Xpert Ultra-négatives, parmi celles-ci 16 (2 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
Chez les personnes non hospitalisées appartenant à des groupes à haut risque (5 études), la sensibilité et la spécificité combinées du test Xpert MTB/RIF étaient de 69,4 % (47,7 à 86,2) (337 participants, données probantes d’un niveau de confiance faible) et de 98,8 % (97,2 à 99,5) (8 619 participants, données probantes d’un niveau de confiance modéré). Sur 1 000 personnes dont 10 ont une tuberculose en culture, 19 seraient Xpert MTB/RIF-positives, parmi celles-ci 12 (63 %) n'auraient pas de tuberculose (faux positifs) ; 981 seraient Xpert MTB/RIF-négatives, parmi celles-ci 3 (0 %) auraient une tuberculose (faux négatifs).
Nous n'avons pas identifié d'études utilisant le test Xpert MTB/RIF ou Xpert Ultra pour le dépistage dans la population générale.
Xpert MTB/RIF comme test de dépistage de la résistance à la rifampicine
La sensibilité du test Xpert MTB/RIF était de 81 % et 100 % (2 études, 20 participants ; données probantes d’un niveau de confiance très faible) et la spécificité de 94 % à 100 % (3 études, 139 participants ; données probantes d’un niveau de confiance modéré).
Post-édition effectuée par Cochrane France. Une erreur de traduction ou dans le texte d'origine ? Merci d'adresser vos commentaires à : traduction@cochrane.fr