Principaux messages
- Les études de cette revue suggèrent que le dépistage du polyomavirus BK dans les échantillons de sang est un outil de dépistage fiable pour détecter le BKPyVAN.
- En utilisant un taux de virus BK dans le sang de 10 000 copies ou plus/ml, les risques de manquer un diagnostic de BKPyVAN étaient de 6 patients pour 1 000 et de diagnostiquer à tort un BKPyVAN alors qu'un patient n'en avait pas était de 48 pour 1 000.
- En utilisant un taux de virus BK dans le sang de 2 000 copies ou plus/ml, les chances de manquer un diagnostic de BKPyVAN étaient de 5 patients pour 1000, et de diagnostiquer à tort un BKPyVAN alors qu'un patient n'en avait pas était de 115 pour 1 000.
Qu'est-ce que BKPyVAN ?
Le polyomavirus BK est un virus dont les symptômes ressemblent fortement à un rhume, qui affecte couramment les gens pendant leur enfance et dont plus de 80 % ont été exposés au virus. Ce virus peut persister dans le rein et ne provoque généralement pas d'effets indésirables, sauf si le système immunitaire est affaibli, comme chez les receveurs de greffe de rein. Le polyomavirus BK peut se répliquer et causer davantage de dommages à la greffe de rein, connue sous le nom de BKPyVAN.
Quelle est la meilleure façon de diagnostiquer BKPyVAN ?
L'une des façons de détecter cela est par une biopsie rénale (où une aiguille creuse est insérée dans le rein pour prélever un très petit échantillon à tester). Cependant, cette méthode est invasive et pas toujours parfaite, car l'aiguille peut manquer la partie du rein affectée par le virus. D'autres méthodes comprennent le dépistage de la présence d'ADN viral dans les échantillons de sang et d'urine à l'aide d'un test appelé test quantitatif d'acide nucléique (TQAN, ou en anglais QNAT) . Le fait de ne pas reconnaître BKPyVAN lorsqu'il est présent (résultat faux négatif) peut entraîner une détérioration de la fonction rénale et peut-être la nécessité de retourner en dialyse. Un diagnostic incorrect lorsqu'une personne n'a pas l'infection (résultat faux positif) peut entraîner une réduction inutile de l'immunosuppression (médicaments pour empêcher son corps d'essayer de combattre (ou de rejeter) ce nouveau rein), augmentant ainsi le risque de rejet d'un rein transplanté.
Que voulions-nous découvrir ?
Nous voulions savoir quelle était la précision du test TQAN pour la quantité de virus BV dans le sang ou l'urine pour diagnostiquer le BKPyVAN. Nous voulions également savoir combien de virus BK dans le sang ou les urines permettrait de prédire si une personne avait réellement un BKPyVAN.
Comment avons-nous procédé ?
Nous avons recherché toutes les études portant sur le test TQAN pour le diagnostic du BKPyVAN chez les personnes ayant reçu une greffe de rein ou une greffe combinée de rein et de pancréas. Nous avons comparé et résumé les résultats des études et évalué notre confiance dans les informations en fonction de facteurs tels que les méthodes et la taille des études.
Qu’avons-nous trouvé ?
Trente et une études (6 559 personnes) ont été incluses dans cette revue. Des études ont été menées en Asie du Sud et dans la région Asie-Pacifique, en Amérique du Nord, en Amérique du Sud et en Europe. Vingt-six études portaient sur des personnes n'ayant subi qu'une greffe de rein, quatre études portaient uniquement sur des receveurs de greffe de rein-pancréas, et une étude portait sur des receveurs de greffe de rein, de rein-pancréas et de foie. Tous les receveurs de greffe avaient au moins 18 ans.
Les résultats indiquent qu'en théorie, en utilisant un taux sanguin de 10 000 copies ou plus du virus BK/ml pour décider si une personne est atteinte de BKPyVAN, chez 1 000 receveurs de greffe de rein, 37 seraient diagnostiqués comme atteints de BKPyVAN ; cependant, 6 seraient classés à tort comme n'ayant pas de BKPyVAN. Sur les 957 patients classés comme n'ayant pas de BKPyVAN, 48 patients positifs seraient classés à tort comme n'ayant pas de BKPyVAN. Si le taux de virus BK sanguin était abaissé à 2 000 copies de virus ou plus/ml, 38 seraient diagnostiqués comme ayant BKPyVAN, et 5 patients positifs ne le seraient pas, tandis que 115 seraient classés à tort comme ayant BKPyVAN.
Quelles sont les limites des données probantes ?
Les études de cette revue suggèrent que le dépistage du polyomavirus BK dans les échantillons de sang est un outil de dépistage fiable pour détecter le BKPyVAN.
Il n'est pas certain que l'utilisation du TQAN sur des échantillons d'urine soit une méthode fiable pour diagnostiquer le BKPyVAN.
Dans quelle mesure les données probantes sont-elles à jour ?
Les données probantes sont à jour au mois de juin 2023.
Les données probantes sont insuffisantes pour suggérer l'utilisation du TQAN du BKPyV dans l’urine comme principal outil de dépistage du BKPyVAN. Les estimations globales de la sensibilité et de la spécificité du test de TQAN du BKPyV dans le sang/sérum/plasma à un seuil de 10 000 copies/ml pour le BKPyVAN étaient de 0,86 (IC à 95 % 0,78 à 0,93) et 0,95 (IC à 95 % 0,91 à 0,97), respectivement. Le modèle à seuil multiple a montré que le seuil optimal était d'environ 2 000 copies/ml, avec une sensibilité du test de 0,89 (IC à 95 % 0,66 à 0,97) et une spécificité de 0,88 (IC à 95 % 0,80 à 0,93). Bien que 10 000 copies/ml soit la valeur seuil la plus couramment utilisée, avec de bonnes caractéristiques de performance des tests et soutienne les recommandations actuelles, il est important d'interpréter les résultats avec prudence en raison du niveau de confiance faible des données probantes.
La néphropathie associée au polyomavirus BK (BKPyVAN) survient lorsque le polyomavirus BK (BKPyV) affecte un rein transplanté, entraînant une lésion initiale caractérisée par des lésions cytopathiques, une inflammation et une fibrose. BKPyVAN peut entraîner une perte permanente de la fonction du greffon et une perte prématurée du greffon. La détection précoce donne aux cliniciens la possibilité d'intervenir en réduisant rapidement l'immunosuppression pour réduire les effets indésirables du greffon. Les tests quantitatifs d'acide nucléique (TQAN, ou QNAT en anglais) pour la détection de l'ADN du BKPyV dans le sang et l'urine sont de plus en plus utilisés comme test de dépistage car le diagnostic du BKPyVAN par biopsie rénale est invasif et associé à des risques procéduraux. Dans cette revue, nous avons évalué la sensibilité et la spécificité des tests TQAN chez les patients atteints de BKPyVAN.
Nous avons évalué la précision diagnostique du TQAN dans le sang/plasma/sérum BKPyV et du TQAN du BKPyV dans l’urine pour le diagnostic du BKPyVAN après transplantation. Nous avons également étudié les sources suivantes d'hétérogénéité : les types et la qualité des études, ère de publication, les différents seuils de BKPyV-DNAemia/BKPyV virurie et la variabilité entre les tests, en tant qu’objectifs secondaires.
Nous avons effectué des recherches dans MEDLINE (OvidSP), EMBASE (OvidSP) et BIOSIS, et avons demandé une recherche dans le registre Cochrane des études diagnostiques de précision des tests depuis leur création jusqu'au 13 juin 2023. Nous avons également effectué une recherche dans le Système d'enregistrement international des essais cliniques (ICTRP) et ClinicalTrials.gov pour les essais en cours.
Nous avons inclus des études transversales ou de cohorte évaluant la précision diagnostique de deux tests index (TQAN du sang/plasma/sérum BKPyV ou TQAN du BKPyV dans l’urine) pour le diagnostic de BKPyVAN, tel que vérifié par le standard de référence (histopathologie). Les études rétrospectives et prospectives de cohorte ont été incluses. Nous n'avons pas inclus les rapports de cas et études cas-témoins.
Deux auteurs de chaque étude ont extrait les données de manière indépendante. Nous avons évalué la qualité méthodologique des études incluses en utilisant l’outil d'évaluation QUADAS-2 (Quality Assessment of Diagnostic-Accuracy études). Nous avons utilisé le modèle à effets aléatoires bi-variés pour obtenir des estimations globales de la sensibilité et de la spécificité du TQAN avec un seuil de positivité. Lorsque les méta-analyses n'ont pas été possibles en raison du petit nombre d'études disponibles, nous avons détaillé les données probantes descriptives et utilisé une approche sommative. Nous avons exploré les sources possibles d'hétérogénéité en ajoutant des covariables aux modèles de méta-régression.
Cette revue a inclus 31 études pertinentes portant sur un total de 6 559 participants. Vingt-six études portaient sur des receveurs de greffes de rein, quatre études sur des receveurs de greffes de rein et de rein-pancréas, et une étude sur des receveurs de greffes de rein, de rein-pancréas et de rein-foie. Des études ont été menées en Asie du Sud et dans la région Asie-Pacifique (12 études), en Amérique du Nord (9 études), en Europe (8 études) et en Amérique du Sud (2 études).
Test index : TQAN du BKPyV dans le sang/sérum/plasma
La performance diagnostique TQAN (test quantitatif d'acide nucléique) du BKPyV dans le sang utilisant un seuil commun de charge virale de 10 000 copies/ml a été rapportée dans 18 études (3 434 participants). Les estimations globales à 10 000 copies/ml comme seuil indiquaient que la sensibilité regroupée était de 0,86 (intervalle de confiance (IC) à 95 % 0,78 à 0,93) tandis que la spécificité regroupée était de 0,95 (IC à 95 % 0,91 à 0,97). Un nombre limité d'études était disponible pour analyser les estimations globales des seuils individuels de charge virale autres que 10 000 copies/ml. La comparaison indirecte des seuils des trois valeurs seuil différentes de 1000 copies/ml (9 études), 5000 copies/ml (6 études) et 10 000 copies/ml (18 études), la valeur seuil la plus élevée à 10 000 copies/ml correspondait à une spécificité plus élevée avec une sensibilité plus faible. Les estimations globales de la comparaison indirecte des seuils supérieurs à 10 000 copies/ml étaient incertaines, principalement en raison du nombre limité d'études avec des IC larges ayant contribué à l'analyse. Néanmoins, ces comparaisons indirectes doivent être interprétées avec prudence car les différences dans le plan d'étude, les populations de patients et les variations méthodologiques entre les études incluses peuvent introduire des biais. L'analyse de toutes les études sur le TQAN du BKPyV sanguin, incluant divers seuils de charge virale sanguine (30 études, 5 658 participants, 7 seuils), a indiqué que la performance du test reste robuste, avec une sensibilité globale de 0,90 (IC à 95 % 0,85 à 0,94) et une spécificité de 0,93 (IC à 95 % 0,91 à 0,95). Dans le modèle à seuils multiples, incluant les différents seuils générant une seule courbe, le seuil optimal était d'environ 2 000 copies/ml, sensibilité de 0,89 (IC à 95 % 0,66 à 0,97) et spécificité de 0,88 (IC à 95 % 0,80 à 0,93). Cependant, comme la plupart des études incluses étaient rétrospectives et que tous les participants n'ont pas subi les tests standards de référence, cela peut entraîner un risque élevé de biais de sélection et de vérification.
Test index : urine BKPyV TQAN
Il n'y avait pas suffisamment de données pour étudier de manière approfondie à la fois la précision et les seuils du TQAN du BKPyV dans l’urine, ce qui a entraîné une estimation imprécise de sa précision sur la base des données probantes disponibles.
Post‐édition effectuée par Elissar El Chami et Cochrane France. Une erreur de traduction ou dans le texte d'origine? Merci d'adresser vos commentaires à: traduction@cochrane.fr