Principaux messages
– Les études incluses dans cette revue suggèrent que les tests moléculaires (qui détectent des molécules contenant les informations génétiques utilisées dans la croissance, le développement, le fonctionnement et la reproduction des bactéries) pourraient être des tests supplémentaires très utiles pour détecter l'infection sanguine (sepsis) chez les nouveau-nés, car ils fournissent des résultats rapides.
– L'utilisation de tests moléculaires pourrait nous aider à arrêter plus rapidement l’utilisation des antibiotiques chez les nourrissons ne présentant pas d’infection sanguine, car les résultats sont disponibles plus rapidement qu’avec les hémocultures (un test qui vérifie la présence de bactéries ou d'autres germes dans le sang). Cependant, des recherches supplémentaires sont nécessaires pour le prouver.
Pourquoi est-il important d'améliorer le diagnostic du sepsis chez les nourrissons ?
Actuellement, pour détecter l'infection (maladie causée par des germes) chez les nouveau-nés, on prélève du sang ou d'autres liquides corporels (ou les deux) et on réalise une culture (développer) des bactéries (germes) dans un laboratoire. Cependant, les méthodes de culture peuvent ne pas inclure certaines infections et le délai d’obtention des résultats peut être très long (48 à 72 heures). Nous avons à disposition des nouveaux tests moléculaires pour détecter les infections. Les tests moléculaires sont rapides et pourraient être plus précis que les méthodes de culture traditionnelles pour détecter les infections.
Qu'est-ce qu'un test moléculaire ?
Un test moléculaire est basé sur la détection de l'ADN (molécule contenant les informations génétiques utilisées dans la croissance, le développement, le fonctionnement et la reproduction) des bactéries et d'autres organismes qui provoquent des infections.
Que voulions‐nous savoir ?
Nous voulions savoir si les tests moléculaires sont plus efficaces pour détecter les infections que les méthodes de culture standards chez les nouveau-nés.
Comment avons-nous procédé ?
Nous avons recherché des études portant sur la précision des tests moléculaires pour détecter les infections chez les nouveau-nés. Nous avons comparé et résumé les résultats des études et évalué le niveau de confiance des données probantes en nous basant sur des facteurs tels que les méthodes et la taille des études.
Qu’avons-nous trouvé ?
Nous avons trouvé 74 études qui comparaient des méthodes moléculaires aux méthodes de culture. Nous n'avons pu utiliser que les données de 68 études, ce qui incluait 14 309 nouveau-nés.
Les résultats de ces études suggèrent que les tests moléculaires pourraient avoir une précision modérée dans la détection des infections chez les nourrissons. Les tests moléculaires peuvent être des tests supplémentaires très utiles pour diagnostiquer les infections sanguines, car le délai d’obtention des résultats est rapide.
Bien que la sélection des nouveau-nés ait posé certains problèmes pour cette revue, dans l'ensemble, les méthodes utilisées par les études étaient satisfaisantes.
Quelles sont les limites des données probantes ?
Les études incluses ont posé le diagnostic d'infection en utilisant l'hémoculture conventionnelle (c'est ce qu'on appelle le standard de référence). Il n'est pas certain que cela détecte correctement tous les nouveau-nés présentant une infection. Nous avons inclus des études s’étendant sur une longue période (1997 à 2022) et les méthodes utilisées pourraient avoir changé, ce qui pourrait expliquer les différences de résultats entre les études. Il est possible que des études avec des résultats moins précis n'aient pas été publiées.
Ces données probantes sont-elles à jour ?
Les données probantes sont à jour jusqu'en août 2023.
Sources de financement des études
Aucune des études n'a reçu de financement.
Les tests moléculaires ont l'avantage de produire des résultats rapides et ont une précision diagnostique modérée. Ces tests moléculaires pourraient prévenir l'utilisation excessive d'antibiotiques chez les nouveau-nés suspectés de sepsis. L'efficacité et le rapport coût-efficacité de ces tests moléculaires doivent être évalués dans des essais randomisés comparant les tests moléculaires en tant que test complémentaire par rapport aux méthodes conventionnelles sans test complémentaire chez les nouveau-nés présentant une suspicion de sepsis.
Les cultures microbiennes pour le diagnostic du sepsis néonatal ont une faible sensibilité et une obtention des résultats tardive. Les progrès en microbiologie moléculaire ont favorisé l’apparition de nouveaux tests moléculaires rapides et susceptibles d'améliorer les résultats chez les nouveau-nés.
Évaluer la précision diagnostique de diverses méthodes moléculaires pour le diagnostic des sepsis bactériennes et fongiques à culture positive chez les nouveau-nés et explorer l'hétérogénéité entre les études en analysant des sous-groupes classés selon l’âge gestationnel et le type d'apparition de la sepsis et comparer les tests moléculaires entre eux.
Nous avons effectué des recherches dans CENTRAL, MEDLINE, Embase et dans les registres d'essais en août 2023. Nous avons vérifié les références bibliographiques des études incluses et des revues systématiques dont le sujet était lié à l'intervention ou à la population examinée dans cette revue.
Nous avons inclus des études prospectives ou rétrospectives et des études de cohorte ou transversales, qui ont évalué des tests moléculaires (test index) chez les nouveau-nés suspectés de sepsis par rapport aux cultures microbiennes (standard de référence).
Deux auteurs de la revue ont indépendamment sélectionné les études, extrait les données et évalué la qualité méthodologique des études incluses. Nous avons effectué des méta-analyses à l'aide du modèle bivarié et saisi les données dans Review Manager.
Soixante-quatorze études étaient éligibles à l'inclusion, dont 68 études ont fourni des données pour méta-analyse. Le nombre total de participants était de 14 309 (dont 1 328 nourrissons dont la culture était positive et 12 981 nourrissons dont la culture était négative) issus des 68 études incluses dans la méta-analyse. L’estimation globale de la sensibilité était de 0,91 % (intervalle de confiance (IC) à 95 % 0,85 à 0,95) et la spécificité était de 0,88 % (IC à 95 % 0,83 à 0,92) (données probantes d’un niveau de confiance faible). Nous avons exploré l'hétérogénéité par des analyses en sous-groupes basées sur le type de test, l'âge gestationnel, le type de début du sepsis et la prévalence du sepsis. Nous n'avons pas trouvé suffisamment d'explications à l'hétérogénéité (données probantes d’un niveau de confiance faible à très faible). Les analyses de sensibilité, y compris les études qui ont analysé des échantillons de sang, qui ont utilisé une méthodologie correcte et celles qui n'ont pas utilisé plusieurs échantillons provenant du même participant ont révélé des résultats similaires (données probantes d’un niveau de confiance faible).
Traduction et Post-édition réalisées par Cochrane France avec le soutien de Domitille Digonnet (bénévole chez Cochrane France) et grâce au financement du Ministère de la Santé. Une erreur de traduction ou dans le texte original ? Merci d’adresser vos commentaires à : traduction@cochrane.fr